A Assassin's Creed a franchise mindig az Assassin Order szemszögéből mesélte történetét. Mivel a Templomos Rend a szabad akarat eltávolításával küzd a békéért, mindig világos volt, hogy kinek van igaza. Van azonban egy cím, amely bemutatta a perspektívát a templomos rend rendjéből - és hogy az egyik turncoat majdnem elpusztította az Assassins gyarmati testvériségét.
Assassin's Creed Rogue bemutatott egy Shay Patrick Cormac nevű fiatal merénylőt, aki közvetlenül a hétéves háború előtt az Amerikai Testvériség tagja volt. Ő és barátja, Liam O'Brien azt a feladatot kapták, hogy levadásszák azokat a műtárgyakat, amelyek a Rend szerint az Édeni darabokhoz voltak kötve. Ezek már jóval a hitvallás születése előtt léteztek, és olyan nagy hatalommal bírtak, hogy ha a templomosok megszereznék az egyikük irányítását, rabszolgává tehetnék az egész emberiséget.
A párosnak sikerült megtalálni az egyik műtárgyat egy Lisszabon alatti ősi templomban. Shay azonban bevette egy földrengést, amely több ezer ember halálát okozta. Ez a tapasztalat arra késztette, hogy higgye, hogy az orgyilkosok nem törődnek az ártatlanokkal, és most a hősök ellentétének tekintik őket. Shay hátat fordított a Rendnek, életét kockáztatva, amikor társai vadásztak rá. Végül megtalálta az utat a Templomos Rend gyarmati rítusához, és onnan az Assassin esküdt ellensége mellé állt, és megfogadta, hogy régi társai soha nem találnak újabb templomot.
A hétéves háború alatt Shay a templomos nagymesterrel, Haytham Kenway-vel levadászta régi merénylőpartnereit. Haytham a kalózgyilkos fia, Edward Kenway volt, de őt a templomosok követésére nevelték fel. Az évek során Haytham és Shay erős alapokra tett szert a kolóniákban, és megnyerték a hétéves háborút a templomosok számára. Megszüntette a Gyarmati Testvériség néhány legerősebb tagját is.
Csúcspontja Assassin's Creed Rogue látta, ahogy Shay megöli régi barátját, Liamet és Haythamot, és megnyomorítja vezetőjüket, Achilles Davenportot. Hét éven át az orgyilkosok szervezetlenek voltak és vezetés nélkül, mivel Shay és a templomosok árnyékból irányították a gyarmatokat. Nem telik el további hét év, amíg Haytham fia, Connor megérkezik, és ott folytatja, ahol Achilles abbahagyta: megszüntette a templomos fenyegetést Amerikában, és segítette az ország győzelmét a brit korona ellen a történelem egyik legfontosabb konfliktusa, az amerikai forradalom idején.
Cormac folytatta a munkát a Templomos Renddel, ősi tárgyak vadászatával, amelyek előnyt segítettek nekik előnyt szerezni az orgyilkosokkal szemben. Amint Connor folytatta a gyarmatok felszabadítását, Shay Párizsban volt, és egy Assassin meggyilkolását kapta, aki egy szent dobozt tartott, amely kinyitotta az ősi titkokat, és még a kínai merénylő, Shao Jun előtt létezett. Az általa meggyilkolt bérgyilkos Arno Dorian, egy bérgyilkos apja volt, aki segíteni fog Párizs felszabadításában Assassin's Creed Unity . Annak ellenére, hogy Shay Cormac nem rombolta le teljesen az Amerikai Orgyilkos Testvériséget, megmutatta, milyen gyorsan tudnak lebomlani, amikor egyikük oldalra vált.
