FIGYELMEZTETÉS: A következő cikk a Elmúlt napok .
Körülbelül 40 órás játékidő után, hogy teljes legyen a fő történet, sok játékos félreteszi vezérlőit és távozik Elmúlt napok végleg . Más egy teljesen új mentési fájlt indít. Azonban azok, akik a kreditdobás után folytatják a játékot, egy titkos végződéssel jutalmazzák, amelynek hatalmas következményei vannak.
Amint az utolsó küldetésnek vége és a Wizard Island megsemmisül, a játék nyílt világtérképe továbbra is elérhető. Innentől kezdve a játékosok befejezhetik a megmaradt mellékcélokat, például a Freaker Hordes vagy a NERO kutatóhelyeket. Egy idő után a játékos rádióüzenetet kap a NERO kutatójától, James O'Briantól, aki megkéri a játékost, hogy találkozzon vele.
Amikor St. John diakónus főszereplő találkozik O'Brian-nal a régi temetőben, a dolgok elkapják. A prológban a játékos megismerkedik O'Brian-nal, aki teljes testű hazmat öltönyt és átlátszó képernyős sisakot visel. Itt látszik az arca. A játék hátralévő részében azonban O’Brian maszkja színezett, vagyis Deek nem látja az arcát.
Ennek oka csak a titkos végkifejlet jelenetében derül ki: O'Brian fertőzött. Végül leveszi a maszkját, hogy felfedje a vércukorszintet, az érrendszert, ami Deacon visszahúzódását okozza. O'Brian elmagyarázza, hogy a Freakereket létrehozó vírus gyorsan fejlődik, és most abban a szakaszban van, amikor behatolhat a nem fertőzött emberek nyirokrendszerébe (amely segít megvédeni a testet a betegségektől és fertőzésektől). Azt is elárulja, hogy a NERO felsőbb tagjai egy ideje tudnak erről, és figyelmezteti Deacont, hogy jönnek. O'Brian távozik, embertelen erővel és mozgékonysággal ugrik a légi helikopterbe.
Ez a jelenet azt sugallja, hogy a vírus ezen új törzse a Freaker egy teljesen új formáját hozza létre, amely fenntartja az ember kognitív funkcióit, de rendelkezik a Deacon által mindvégig küzdő lények erejével, sebességével és agressziójával. Elmúlt napok . Valójában ennek a jelenetnek több pontján O'Brian teste önkéntelennek tűnő rángásokat hajt végre, és még néhány lépést tesz Deek felé, mielőtt elnézést kérne. Bár soha nem szerepel kifejezetten, úgy tűnik, hogy az O'Brian ellenáll a vírus által kiváltott biológiai támadásnak.
Nyilvánvaló, hogy ennek a jelenetnek az volt a célja, hogy nyitva hagyja az ajtót a Elmúlt napok folytatás, valami, ami most úgy tűnik, hogy soha nem fog megtörténni. Ahelyett, hogy Deek optimista véget ért volna a naplementébe Sarah-val, ez a fordulat sötétebb, fenyegetőbb hangon fejezte be a játékot. Az O'Brian révén bevezetett Freaker új formája félelmetes ellenséget teremtett volna egy második játékban, amely biztosan követte volna Deacon erőfeszítéseit, hogy feltárja az igazságot a NERO vírushoz fűződő kapcsolatáról.
Érdemes megjegyezni, hogy bár a NERO kiemelkedő szerepet játszik benne Elmúlt napok , Deacon valójában soha nem harcol ellenük. Azokban a küldetésekben, ahol szerepelnek, Deek csak a katonák és a kutatók körül tud lopakodni, mivel a játék egyértelművé teszi, hogy az öltönyük túl erős ahhoz, hogy átvághasson vagy lőhessen. A folytatás valószínűleg a NERO-t tette volna a fő antagonistává, Deaconnak és a társaságnak szembe kellett néznie velük. A dolgok jelenlegi állása szerint azonban ez egy történet, amely megmarad.
