A sorozat készítői, Carter Bates és Craig Thomas pontosan tudták, hogyan akarják így jártam anyátokkal még a jelenetek forgatása Ted gyerekeivel évekkel a show befejezése előtt. Ezzel a kihívással Batesnek és Thomasnak ki kellett töltenie a rést a pilóta és a finálé között, miközben a befejezés sértetlen maradt. A sorozat növekedésével azonban a karakterek fejlődött, az előre megtervezett finálé sok rajongó számára savanyúnak érezte magát, akik a kezdetektől fogva követték a műsort, és egy petíciót írtak átírást követelve.
A frusztráció a így jártam anyátokkal az utolsó kilencedik évad. A showrunnerek egészen más megközelítés mellett döntöttek a 9. évaddal; Ahelyett, hogy egy egész éven át játszott volna eseményeket, a megelőző három napra épült Barney és Robin esküvője. Míg az évad vegyes kritikákat kapott a közönség részéről, a sorozatzáró okozta a legnagyobb felhajtást. Az utolsó két epizód a szokásos szituációs befejező útvonalon haladt, és életük részleteinek bemutatásával mutatta meg, hogy hol lesznek a szereplők a jövőben. Ez azt is megmutatta, hogy Tracy McConnell, az Anya ismeretlen okokból távozott. Amikor az epizód véget ért, a nézők Tedet és Tracy-t látták az első találkozásuk során, amely 2030-ban Tedig vezetett, és befejezte a hosszas szálat arról, hogyan találkozott vele.
A történet azonban ezzel nem ér véget. A 2. évad kezdete körül Lyndsy Fonseca és Luke Henry - azok a színészek, akik Luke-ot és Penny Mosbyt ábrázolták - azért forgatták a fináléjeleneteket, hogy fenntartsák a tinédzserek színészeinek korát, amikor eljött az idő, hogy a műsor lezáruljon. Ennek köszönhetően, így jártam anyátokkal azzal ért véget, hogy a gyerekek rájöttek, hogy az egész történetet elmesélték nekik, hogy engedélyt adhassanak apjuknak randevúzni Robinnal, mert szerelmes belé. Engedélyt adtak neki, és a sorozat a kezdetekor befejeződik, amikor Ted Robin lakása előtt áll, kék tubát tartva, megkérve, hogy adjon neki esélyt.
Ennek oka sok néző csalódása volt, mert a sorozat többször utalt arra, hogy Robin és Ted nem sikerül. Csak egy évadon keresztül randevúztak, mielőtt megszakították, majd évekkel később megpróbálták újra feléleszteni a kapcsolatot, hogy újra rájöjjenek, hogy jobban járnak egymástól. Sok rajongó követelte ennek visszavonását emiatt, valamint azt a tényt, hogy a sorozat éveken át sokkal jobb szerelmi történetet épített Barney-val és Robinnal, amely megolvasztotta a szívét, míg Ted és Robin teljes kapcsolata csupán utólagos gondolat lett.
A rajongók csak az alternatív befejezés megjelenéséig voltak kissé elégedettek. Teljesen kivágja az anya halálát és a jeleneteket Ted gyerekeivel. Ez azt mutatja, hogy Ted az esküvőjén, barátaival körülvéve, Ted hangfelvételével összefoglalja az utat, sőt utal arra a tényre, hogy Barney és Robin újra összejönnek, miközben a valódi befejezés csak közös bólintást adott a közönségnek. Ez a váltakozó befejezés az, amelyet a rajongók megérdemeltek és látniuk kellett, és a többség úgy véli, hogy ez az igazi.
így jártam anyátokkal nem volt az első sorozat, amelynek vége csalódást okozott, és bizonyosan nem is az utolsó, mivel a katasztrofális döntők Trónok harca és Természetfölötti amelyeket a mai napig az utolsó szezonjaik átírása érdekében halmoznak. Ennek ellenére a közönség még mindig élvezheti az utazást Így jártam anyátokkal, ha megtalálják az „alternatív befejezést”, hogy kielégítő hangon fejezzék be.
